Появление и распространение болезни легче предупредить, чем лечить. Болезни бывают заразные (инфекционные), инвазионные и незаразные. Незаразные болезни в большинстве случаев возникают вследствие недокорма, плохого ухода и содержания животных. Заразные болезни вызываются болезнетворными микробами или паразитами, попадающими в организм животного. Заразные болезни могут передаваться от одного животного другому непосредственно или через переносчиков (люди, животные, птицы, насекомые), через предметы ухода за животными, через корм, воду и др. Восприимчивость животных к заразным заболеваниям неодинакова. В плохих условиях содержания и кормления животные скорее поддаются заболеваниям, более тяжело болеют, труднее вылечиваются.

Заразные болезни коз могут быть занесены в хозяйство (стадо) со стороны с больными животными, с зараженным фуражом, инвентарем, с людьми, побывавшими в зараженном хозяйстве; поэтому нельзя допускать на территорию фермы животных, больных заразными болезнями. Вновь ввозить коз можно только из хозяйств, благополучных по заразным заболеваниям. На ввозимых животных должно быть ветеринарное свидетельство о состоянии их здоровья. Признаки заразной болезни обнаруживаются лишь через некоторый срок после заражения (инкубационный период), а при некоторых болезнях признаки вообще мало заметны или отсутствуют; поэтому необходимо всех животных, вновь поступающих в хозяйство, предварительно подвергать тщательному ветеринарному осмотру и отдельно содержать (карантинировать) их в течение срока, установленного ветеринарными специалистами. В районах, где наблюдаются массовые глистные заболевания коз, следует ежегодно (весной, перед выпуском на пастбище, осенью, перед постановкой в помещения) проводить предупредительное (профилактическое) противоглистное лечение животных во избежание распространения глистных заболеваний.

Для водопоя коз не следует использовать мелкие водоемы со стоячей водой (лужи, болота, мелкие запруды и т.д.), так как такие водоемы являются источником глистных заболеваний. В пастбищный период через 5-6 дней должна происходить смена участков пастбищ. Возвращать коз на старые участки следует через 2-3 месяца. При таком чередовании выпасов достигается их оздоровление. Для профилактики массовых заболеваний конечностей в области копыт у коз следует постоянно следить за состоянием полов в помещениях и глубокой подстилки, периодически осматривать поголовье, выделять в отдельную группу хромающих животных, систематически обрабатывать копыта в дезинфицирующих ваннах с 10%-ным раствором медного купороса и формалина. В благополучных стадах ванны с профилактической целью применяют один раз в 10 дней. Высота раствора в ванне должна быть такой, Чтобы были погружены копыта передних и задних конечностей.
Дно у ванны должно быть с шероховатой поверхностью. Ванны устраивают перед входом в помещение, на пути перехода животных из одного помещения в другое.  Чтобы предупредить мацерацию кожи мякишей, межкопытной щели, венчика и рогового башмака, наступающую при длительном содержании коз в сырых помещениях, при загрязнении полов, выгульных площадок, загонов полужидким навозом, необходимо регулярно очищать полы, выгульные площадки, загоны от навоза и загрязнений.

Для предупреждения безоарной болезни полезно использовать минеральные брикеты, которые готовят в летнее время. На 100 кг молотого мела берут 8-10 кг поваренной соли, 50 г железного купороса, 20 г химически чистого хлористого кобальта. Размешивают в воде до кашицеобразного состояния. Полученной массе придают форму брикета. Перед подачей животным брикет измельчают, перемешивают (до 30% к объему) с фосфорной подкормкой (кормовой преципитат, обесфторенный фосфат и др.) и раскладывают по кормушкам. Профилактика маститов заключается в создании условий, исключающих покусы, ссадины и травмирование (ушибы) вымени в период подсоса и доения. При заболевании вымени надо своевременно выделить больную козу в отдельную клетку и начать лечение. Заболевания могут передаваться через плаценту и зародышевые оболочки в процессе козления, через вагинальные выделения после козления.

Вероятность заражения животных увеличивается, если происходит абортирование плода. После аборта плод сжигают или закапывают. Очищают место козления и заменяют подстилку. Для предупреждения желудочно-кишечных заболеваний следует обеспечивать коз хорошей водой и кормами высокого качества. Глубокосукозным маткам с профилактической целью следует давать корма, содержащие каротин и минеральную подкормку, в зимнее время полезны прогулки и ультрафиолетовое облучение. При недостатке минеральных элементов используют премиксы (медь сернокислая 0,017 г, марганец сернокислый 0,067, ами-лоидин 0,065, отруби 17000, сера 3000, соль поваренная 10000 г). Профилактическая доза 40 г премикса на матку. Для профилактики легочных заболеваний козлят следует устранить такие предрасполагающие факторы, как сквозняки, сырость, загазованность помещений в зимнее время, вводить с профилактической целью сыворотку реконвалесцентов и антибиотики.